কিডনিতে সমস্যা থাকলে বিটরুট খাওয়ার আগে সাবধান হতে হবে। বিটরুটে বিদ্যমান অক্সালেট শরীরের ক্যালসিয়ামের সংস্পর্শে এসে কিডনিতে ক্যালসিয়াম অক্সাইড নামে পাথর তৈরি করতে পারে। তাই যাঁদের আগে থেকেই কিডনির সমস্যা আছে বা কিডনিতে পাথর আছে, বিটরুট খাওয়ার ব্যাপারে তাঁদের অবশ্যই সতর্ক হতে হবে।
যকৃৎ ও কিডনির রোগের বিশেষ কিছু ওষুধের সঙ্গে বিটরুট না খাওয়াই শ্রেয়। এ ক্ষেত্রে যাঁরা যকৃৎ বা কিডনি রোগে আক্রান্ত, তাঁদের ওষুধ চলমান অবস্থায় বিটরুট খেলে কোনো ক্ষতিকর প্রভাব পড়ছে কি না, খেয়াল রাখতে হবে।